MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 chromosome

Total Repeats: 32204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018673	AGA	2	6	21	26	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407717514
2	NC_018673	AATCA	2	10	34	43	60 %	20 %	0 %	20 %	407717514
3	NC_018673	TTCG	2	8	75	82	0 %	50 %	25 %	25 %	407717514
4	NC_018673	TGA	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717514
5	NC_018673	ATT	2	6	166	171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407717514
6	NC_018673	TTA	2	6	236	241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407717514
7	NC_018673	GTT	2	6	355	360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407717514
8	NC_018673	ATTTA	2	10	434	443	40 %	60 %	0 %	0 %	407717514
9	NC_018673	TGG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407717514
10	NC_018673	GCAA	2	8	477	484	50 %	0 %	25 %	25 %	407717514
11	NC_018673	A	6	6	604	609	100 %	0 %	0 %	0 %	407717514
12	NC_018673	TGA	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717514
13	NC_018673	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407717514
14	NC_018673	TTG	2	6	761	766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407717514
15	NC_018673	ATG	2	6	893	898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717514
16	NC_018673	CAA	2	6	1015	1020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407717514
17	NC_018673	CAA	2	6	1075	1080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407717514
18	NC_018673	A	6	6	1135	1140	100 %	0 %	0 %	0 %	407717514
19	NC_018673	TGG	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407717514
20	NC_018673	CAAC	2	8	1256	1263	50 %	0 %	0 %	50 %	407717514
21	NC_018673	TGAC	2	8	1319	1326	25 %	25 %	25 %	25 %	407717514
22	NC_018673	ATG	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717515
23	NC_018673	AAC	2	6	1612	1617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407717515
24	NC_018673	GAA	2	6	1658	1663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407717515
25	NC_018673	TTA	2	6	1740	1745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407717515
26	NC_018673	A	7	7	1745	1751	100 %	0 %	0 %	0 %	407717515
27	NC_018673	TGG	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407717515
28	NC_018673	T	7	7	1778	1784	0 %	100 %	0 %	0 %	407717515
29	NC_018673	CAG	2	6	1806	1811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407717515
30	NC_018673	GAT	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717515
31	NC_018673	CAG	2	6	1947	1952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407717515
32	NC_018673	AATT	2	8	1956	1963	50 %	50 %	0 %	0 %	407717515
33	NC_018673	ATT	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407717515
34	NC_018673	CAAA	2	8	1976	1983	75 %	0 %	0 %	25 %	407717515
35	NC_018673	CA	3	6	1996	2001	50 %	0 %	0 %	50 %	407717515
36	NC_018673	ATT	2	6	2141	2146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407717515
37	NC_018673	ACAT	2	8	2242	2249	50 %	25 %	0 %	25 %	407717515
38	NC_018673	TTA	2	6	2264	2269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407717515
39	NC_018673	ACA	2	6	2315	2320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407717515
40	NC_018673	CGT	2	6	2398	2403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407717515
41	NC_018673	TCAG	2	8	2485	2492	25 %	25 %	25 %	25 %	407717515
42	NC_018673	ATA	2	6	2631	2636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407717515
43	NC_018673	CACT	2	8	2869	2876	25 %	25 %	0 %	50 %	407717516
44	NC_018673	AGA	2	6	2888	2893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407717516
45	NC_018673	ATT	2	6	2898	2903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407717516
46	NC_018673	TCT	2	6	2904	2909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407717516
47	NC_018673	GAA	2	6	2964	2969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407717516
48	NC_018673	CGT	2	6	2973	2978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407717516
49	NC_018673	A	6	6	2982	2987	100 %	0 %	0 %	0 %	407717516
50	NC_018673	ACGT	2	8	3024	3031	25 %	25 %	25 %	25 %	407717516
51	NC_018673	TGA	2	6	3053	3058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717516
52	NC_018673	ACA	2	6	3074	3079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407717516
53	NC_018673	TGC	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407717516
54	NC_018673	AAG	2	6	3169	3174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407717516
55	NC_018673	CGT	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407717516
56	NC_018673	TGG	2	6	3215	3220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407717516
57	NC_018673	TTG	2	6	3383	3388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407717517
58	NC_018673	TTTAGC	2	12	3403	3414	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407717517
59	NC_018673	AGT	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717517
60	NC_018673	AAG	2	6	3465	3470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407717517
61	NC_018673	GC	3	6	3544	3549	0 %	0 %	50 %	50 %	407717517
62	NC_018673	AT	3	6	3586	3591	50 %	50 %	0 %	0 %	407717517
63	NC_018673	TTATT	2	10	3606	3615	20 %	80 %	0 %	0 %	407717517
64	NC_018673	AGA	2	6	3622	3627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407717517
65	NC_018673	CGA	2	6	3662	3667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407717517
66	NC_018673	ACA	2	6	3711	3716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407717517
67	NC_018673	CTTA	2	8	3753	3760	25 %	50 %	0 %	25 %	407717517
68	NC_018673	GCA	2	6	3884	3889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407717517
69	NC_018673	TTG	2	6	4053	4058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407717517
70	NC_018673	TGA	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717517
71	NC_018673	ATTCA	2	10	4076	4085	40 %	40 %	0 %	20 %	407717517
72	NC_018673	ATG	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717517
73	NC_018673	CAA	2	6	4127	4132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407717517
74	NC_018673	AAC	2	6	4135	4140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407717517
75	NC_018673	GCA	2	6	4177	4182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407717517
76	NC_018673	CTA	2	6	4208	4213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407717517
77	NC_018673	GAT	2	6	4214	4219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717517
78	NC_018673	AC	3	6	4250	4255	50 %	0 %	0 %	50 %	407717517
79	NC_018673	CAT	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407717517
80	NC_018673	GAA	2	6	4379	4384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407717517
81	NC_018673	GAA	2	6	4470	4475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407717518
82	NC_018673	AAT	2	6	4476	4481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407717518
83	NC_018673	GAT	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717518
84	NC_018673	GAA	2	6	4521	4526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407717518
85	NC_018673	ACA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407717518
86	NC_018673	TTG	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407717518
87	NC_018673	TGA	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717518
88	NC_018673	CAAAA	2	10	4797	4806	80 %	0 %	0 %	20 %	407717518
89	NC_018673	TGG	2	6	4850	4855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407717518
90	NC_018673	GGT	3	9	4866	4874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407717518
91	NC_018673	TGG	2	6	4886	4891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407717518
92	NC_018673	GTT	2	6	4914	4919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407717518
93	NC_018673	TAT	2	6	4971	4976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407717518
94	NC_018673	CAGATA	2	12	5068	5079	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407717518
95	NC_018673	TTG	2	6	5115	5120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407717518
96	NC_018673	T	6	6	5141	5146	0 %	100 %	0 %	0 %	407717518
97	NC_018673	CAGT	2	8	5190	5197	25 %	25 %	25 %	25 %	407717518
98	NC_018673	GAA	2	6	5298	5303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407717518
99	NC_018673	GTT	2	6	5313	5318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407717518
100	NC_018673	TAA	2	6	5372	5377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407717518
101	NC_018673	GGT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407717518
102	NC_018673	TCAA	2	8	5532	5539	50 %	25 %	0 %	25 %	407717518
103	NC_018673	ATG	2	6	5643	5648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717518
104	NC_018673	CCA	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407717518
105	NC_018673	TTG	2	6	5674	5679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407717518
106	NC_018673	ATA	2	6	5788	5793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407717518
107	NC_018673	TCG	2	6	5827	5832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407717518
108	NC_018673	GGT	2	6	5847	5852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407717518
109	NC_018673	GAA	2	6	5955	5960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407717518
110	NC_018673	ATT	2	6	5969	5974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407717518
111	NC_018673	ATT	2	6	6039	6044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407717518
112	NC_018673	TATATT	2	12	6135	6146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407717518
113	NC_018673	ACC	2	6	6152	6157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407717518
114	NC_018673	TGA	2	6	6209	6214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717518
115	NC_018673	GA	3	6	6286	6291	50 %	0 %	50 %	0 %	407717518
116	NC_018673	ACA	2	6	6315	6320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407717518
117	NC_018673	TCG	2	6	6335	6340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407717518
118	NC_018673	CGT	2	6	6420	6425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407717518
119	NC_018673	GAA	2	6	6435	6440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407717518
120	NC_018673	TTG	2	6	6451	6456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407717518
121	NC_018673	AT	3	6	6473	6478	50 %	50 %	0 %	0 %	407717518
122	NC_018673	CAT	2	6	6623	6628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407717519
123	NC_018673	TCG	2	6	6702	6707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407717519
124	NC_018673	GAT	2	6	6720	6725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717519
125	NC_018673	A	6	6	6757	6762	100 %	0 %	0 %	0 %	407717519
126	NC_018673	ATC	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407717519
127	NC_018673	TGC	2	6	6915	6920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407717519
128	NC_018673	ATG	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717519
129	NC_018673	TAC	2	6	7040	7045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407717519
130	NC_018673	CAA	2	6	7103	7108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407717519
131	NC_018673	TGA	2	6	7157	7162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717519
132	NC_018673	CAA	3	9	7175	7183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407717519
133	NC_018673	GGT	2	6	7225	7230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407717519
134	NC_018673	ATT	2	6	7339	7344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407717519
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262	NC_018673	CAA	2	6	13725	13730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407717525
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